科学家掌握了癌症的“进化史”，攻克癌症不再

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对肿瘤进行全基因组分析，发现致癌基因并作为靶点进行治疗是未来精准医疗思路。但是肿瘤基因组不断变异和进化导致对靶向药物耐受一直以来是治疗效果不理想的主要原因。科学家们利用单细胞技术和测序手段对肿瘤组织的异质性进行了大量的研究，从肿瘤细胞亚群进化的角度对靶向治疗的耐药性机制做了很多研究。但是对于肿瘤细胞基因组进化过程中不同变异之间依赖性的研究就很少有报道。在这个研究中，研究人员利用生物信息手段分析了肿瘤基因组进化过程中不同变异之间的协同作用，发现致癌基因出现的同时，伴随有其他基因变异的产生，形成相互作用的网络，功能上相互支持。因此，肿瘤增强适应性的同时，也暴露了它的“阿喀琉斯之踵”。 来自瑞士洛桑大学的研究人员首先分析了TCGA收录的6456个样本的23中肿瘤类型，筛选出505种影响肿瘤功能的变异，包含了碱基替换、缺失、插入以及大片段的插入、缺失，基因拷贝数改变。 研究人利用自己开发的算法，分析这些变异的协同变化趋势。鉴定出相互依赖的变异224组，相互排斥的变异407组。同时，肿瘤变异的协同变化呈现出组织特异性的趋势。急性髓性白血病（AML）中常见的协同变化DNMTA，NPM1 和 FLT3； 透明细胞肾癌中常见的有VHL和PBRM1协同突变。当然，还有有些基因的突变通常与很多不同的基因变异联系在一起，这样的基因通常是影响到下游信号网络的转录因子一类，比如KRAS、TP53、RNF43。 研究人员利用这个模型研究肿瘤耐药性，发现突变协同发生的肿瘤细胞对药物耐药性显著高于单个突变发生的细胞系，提供了肿瘤突变基因协同变异造成耐药性的解释。为耐药性肿瘤治疗提供了参考。