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简介:Ion Proton™ 平台是一种利用半导体微芯片技术的台式高通量测序仪。该测序仪的半导体芯片上布满了高密度的小孔,每一个小孔就是一个测序反应池,孔底部带有一种探针-离子选择性场效应晶体管(ISFET),用来探测PH值的变化。
Ion Proton™ 平台
一、 原理介绍
Ion Proton™ 平台是一种利用半导体微芯片技术的台式高通量测序仪。该测序仪的半导体芯片上布满了高密度的小孔,每一个小孔就是一个测序反应池,孔底部带有一种探针-离子选择性场效应晶体管(ISFET,用来探测PH值的变化。测序过程中,每个微孔里都装着一个待测的单链DNA模板和一个DNA聚合酶,当DNA聚合酶把核苷酸聚合到延伸的DNA链上时,会释放出一个氢离子,反应池中的PH发生改变,此时位于池下的ISFET传感器就会探测到信号,进而把化学信号直接转化为数字信号,最终读出DNA序列。与其它新一代测序仪相比,Ion Proton™ 平台不需要激发光、CCD成像仪及荧光标记,可最大程度地简化处理高通量系统生成的数据所需的计算硬件,能直接并快速“读”出DNA序列,具有简单、快速、准确、灵活和低成本等显著优势,是中等规模测序项目的选择。
 
二、 性能参数
 
Ion Proton™
Total output
Up to 10 Gb
Run time
2-4 hours
Read length
200 bp
Total reads
60-80M
 
 
 
三、 测序流程
流程:文库构建自动化emPCR(准备模板)上机测序数据分析
 
四、 主要应用
1、 全基因组测序
2、 人类外显子组测序
3、 未知基因组序列的全新测序和已知基因组序列的再测序
4、 染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)研究
5、 转录组测序和表达谱分析,
6、 目标片段测序和扩增子测序,
 
五、 优势
1、 操作简单化:手动操作时间短,emPCR和回收相对FLX+从试剂和操作时间都简单很多,实现了完全自动化,减少了人为的干预,而且emPCR自动扩增设备和回收设备不需要额外订购
2、 快速:从文库构建到数据产出只需2天,上机测序只需2-4小时,且无需额外订购其它高通量测序系统要求的昂贵的大型计算硬件。
3、 应用范围广:应用到医学临床上更方便,有文献报道Ion ProtonHiSeq能够更好的检测外显子测序中的单核苷酸变异