科海拾贝丨科学家揭示T细胞淋巴瘤(CTCL)表观遗
The great ocean of truth lay all undiscovered before me.——Isaac Newton
而我对面前真正的真理之海,仍然一无所知。——艾萨克·牛顿
基因表达调控是一个多因素影响,多步骤参与的过程,表观遗传调控作为基因表达调控的重要环节,也肿瘤发生和影响治疗过程中起着重要作用。最近,科学家门通过一种名为ATAC-seq的新技术研究了T细胞淋巴瘤的表观遗传模式以及对组蛋白乙酰化酶抑制剂治疗的反应。
ATAC-seq(Assay of transposase-accessible chromatin with sequencing)是一种借助测序手段研究转录因子结合到基因转录调控位点能力的技术,通过这种技术,我们可以预测转录因子结合到染色质的位置以及可能的基因表达谱。
CTCL是一种由T淋巴细胞克隆性增生造成的较为罕见的复杂性疾病,晚期的CTCL如Sézary综合症,癌细胞可以转移至血液,导致T细胞白血病,是一种非常致命的疾病。研究人员通过流式分离正常人群和CTCL病人的正常CTCL细胞和宿主细胞,利用ATAC-seq技术分析着两个群体中染色质开放位点,鉴定出CTCL特有的表观遗传模式以及对应的转录因子作用网络。
组蛋白乙酰化是调控染色质开放的一种机制,文章的作者还研究了染色质开放位点图谱与组蛋白乙酰化酶抑制剂(HDACi)治疗CTCL效果的关系,揭示了组蛋白去乙酰化酶抑制剂治疗个体过程中CTCL染色质开放状态的动态变化,准确地预测了HDACi在个性化治疗中的敏感性。
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