Ion Proton™

简介：Ion Proton™ 平台是一种利用半导体微芯片技术的台式高通量测序仪。该测序仪的半导体芯片上布满了高密度的小孔，每一个小孔就是一个测序反应池，孔底部带有一种探针-离子选择性场效应晶体管（ISFET），用来探测PH值的变化。

Ion Proton™ 平台

一、原理介绍

Ion Proton™ 平台是一种利用半导体微芯片技术的台式高通量测序仪。该测序仪的半导体芯片上布满了高密度的小孔，每一个小孔就是一个测序反应池，孔底部带有一种探针-离子选择性场效应晶体管（ISFET），用来探测PH值的变化。测序过程中，每个微孔里都装着一个待测的单链DNA模板和一个DNA聚合酶，当DNA聚合酶把核苷酸聚合到延伸的DNA链上时，会释放出一个氢离子，反应池中的PH发生改变，此时位于池下的ISFET传感器就会探测到信号，进而把化学信号直接转化为数字信号，最终读出DNA序列。与其它新一代测序仪相比，Ion Proton™ 平台不需要激发光、CCD成像仪及荧光标记，可大量简化处理高通量系统生成的数据所需的计算硬件，能直接并快速“读”出DNA序列，具有简单、快速、准确、灵活和低成本等显著优势，是中等规模测序项目的选择。

二、性能参数

	Ion Proton™
Total output	Up to 10 Gb
Run time	2-4 hours
Read length	200 bp
Total reads	60-80M

三、测序流程

流程：文库构建→自动化emPCR（准备模板）→上机测序→数据分析

四、主要应用

1、全基因组测序

2、人类外显子组测序

3、未知基因组序列的全新测序和已知基因组序列的再测序

4、染色质免疫共沉淀（ChIP-seq）研究

5、转录组测序和表达谱分析，

6、目标片段测序和扩增子测序，

五、优势

1、操作简单化：手动操作时间短，emPCR和回收相对FLX+从试剂和操作时间都简单很多，实现了完全自动化，减少了人为的干预，而且emPCR自动扩增设备和回收设备不需要额外订购

2、快速：从文库构建到数据产出只需2天，上机测序只需2-4小时，且无需额外订购其它高通量测序系统要求的昂贵的大型计算硬件。

3、应用范围广：应用到医学临床上更方便，有文献报道Ion Proton比HiSeq能够更好的检测外显子测序中的单核苷酸变异