转录组(mRNA)测序与云计算数据分析

转录组测序(transcriptome sequencing)的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，可从整体水平研究基因功能以及基因结构，发现不同生理或者病理状态下细胞、组织或个体内差异表达的基因。目前已广泛应用于基础研究、分子育种、临床诊断和药物研发等领域。

应用领域

分析平台特色

接收到用户数据后分析报告的交付周期从传统的2周提高到1天。
弹性计算可以同时计算大量的订单，免去用户排队的烦恼。
平台运维智能化，提供良好的用户体验。

平台可实现同一样本多次分析

样品要求

1. 总RNA：针对Illumina测序平台，浓度≥80 ng/ul，总量≥12 μg；OD260/280介于1.8-2.2之间，OD260/230值应≥2.0。电泳检测28S:18S至少大于1.5；并确保RNA无降解，无污染。
2. 组织样品：动物、植物、微生物总量大于500 mg的新鲜样品(植物材料应尽量选取幼嫩部位)。采样后将样品立即用RNAlater和液氮速冻，保存于-80℃(保存期不超过一个月)，送样时使用干冰运输(不超过72 h)；提取RNA后经变性电泳，保证各RNA条带清晰、比例适中、完整性好、无降解。特别要求样品分成3份，方便后续提取，避免同一份样品反复冻融造成样品降解。
3. 细胞样品：先使用TRIzol试剂进行处理，每0.25 mL样品(5-10×106个细胞)加入0.75 mL TRIzol试剂(可参考TRIzol试剂说明书)，于-80℃保存，并提供2-3份该样品。原则上不接收未经TRIzol处理的细胞样品。