Small RNA(microRNAs、siRNAs和 piRNAs)是生命活动重要的调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Illumina能够对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。实验时首先将18-30 nt范围的Small RNA从总RNA中分离出来，两端分别加上特定接头后体外反转录做成cDNA再做进一步处理后，利用测序仪对DNA片段进行单向末端直接测序。通过Illumina对Small RNA大规模测序分析，可以从中获得物种全基因组水平的miRNA图谱，实现包括新miRNA分子的挖掘，其作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表分析，miRNAs聚类和表达谱分析等科学应用。
Small
RNA是一类长度在18～34nt的RNA分子，主要包括miRNA、siRNA、snRNA、snoRNA、rRNA、tRNA和piRNA等。Small
RNA能调控基因表达，在细胞生长、发育、代谢等基础生物学过程中都扮演着重要的角色，甚至在癌症等相关疾病形成过程中也起着关键的作用。高通量测序技术省去了烦琐的Small
RNA克隆文库构建过程，可以一次性生成上百万条Small RNA序列，能够快速鉴定特定条件下表达的已知Small RNA并发现新的Small
RNA，同时还可以研究不同条件下Small RNA的表达差异，并可以联合转录组测序表达谱数据进行关联分析。
应有领域
样品要求
1. 总RNA：浓度≥200
ng/μl，总量≥3
μg；OD260/280介于1.8-2.2之间，OD260/230值应≥2.0。电泳检测28S:18S至少大于1.5；并确保RNA无降解，无污染。提取总RNA时，请避免使用过柱法和LiCl沉淀法，以避免Small
RNA的丢失。
2. 组织样品：动物、植物、微生物总量大于500
mg的新鲜样品(植物材料应尽量选取幼嫩部位)。采样后将样品立即用RNAlater和液氮速冻，保存于-80℃(保存期不超过一个月)，送样时使用干冰运输(不超过72
h)；提取RNA后经变性电泳，保证各RNA条带清晰、比例适中、完整性好、无降解。特别要求样品分成3份，方便后续提取，避免同一份样品反复冻融造成样品降解。
3. 细胞样品：先使用TRIzol试剂进行处理，每0.25 mL样品(5-10×106个细胞)加入0.75 mL TRIzol试剂(可参考TRIzol试剂说明书)，于-80℃保存，并提供2-3份该样品。原则上不接收未经TRIzol处理的细胞样品。
4. Small RNA：要求从1-10 μg的总RNA中纯化，一般不推荐客户提供。
5. 样品保存期间切忌反复冻融。
6. 送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm膜密封。
