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全基因组甲基化测序(Whole Genome BS-Seq)是将重亚硫酸盐(Bisulfite)处理方法和Illumina高通量测序平台相结合,对有参考基因组信息的物种进行全基因组范围内的甲基化水平的测序。可以精确到单碱基分辨率,精确分析每一个C碱基的甲基化状态,从而构建全基因组甲基化图谱。