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ChIP-Seq

染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP 与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq 技术,能够高效地检测全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。

      染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP 与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq 技术,能够高效地检测全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。
        ChIP-Seq 的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA 片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA 区段信息。

 
样品要求

1、质量要求:ChIP DNA OD 260/280应在1.8至2.0之间。DNA片段大小在100-500 bp范围内,主带明显,建议在250 bp左右,同时请提供DNA打断时的检测胶图。样品最好经过ChIP-PCR验证。

2、浓度要求:样品量≥60 ng,浓度≥200 pg/μl。若单次ChIP后DNA量不够,建议将2-3次ChIP的DNA合并在一起。

3、样品包装:样品溶于超纯水中,放于DNase-free的1.5 ml离心管中,管口用封口膜封好。请在样品管上做好清楚的标识,最好写在标签纸上,贴在管壁。

4、样品信息:请仔细填写样品信息表,并且请同时提供质量检测相关数据和图片,包括分光光度、电泳胶图或Nanodrop仪器检测数据等。同样品一起送样。

5、样品运输:DNA样品请用干冰或者冰袋运输。干冰运输时间不要超过72小时;冰袋运输,时间最好不要超过24小时。