微生物基因组重测序
概述: 伴随着基因组测序技术的进步,被测序的微生物基因组越来越多。基因组重测序是指对基因组序列已知的物种个体进行基因组测序,从而获得该物种个体或群体的差异 的测序方法。目前微生物基因组重测序被广泛应用于病原微生物的检测及鉴定、病原菌演变及起源、致病菌种群结构及种群结的进化等众多方面。
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常见问题
        伴随着基因组测序技术的进步,被测序的微生物基因组越来越多。基因组重测序是指对基因组序列已知的物种个体进行基因组测序,从而获得该物种个体或群体的差异 的测序方法。目前微生物基因组重测序被广泛应用于病原微生物的检测及鉴定、病原菌演变及起源、致病菌种群结构及种群结的进化等众多方面。
 

样品要求

1、细菌:Miseq DNA PE 文库浓度≥20 ng/ μl,总量≥6 μg(荧光定量);Miseq DNA MP 文库浓度≥40 ng/ μl,总量≥12 μg(荧光定量);454 DNA库浓度≥20 ng/ μl,总量≥3 μg(荧光定量)。电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整,主带应在100 kb以上,DNA无降解,无污染。提供菌粉>1g,菌液>5 ml,尽量提供较多量,不同的物种DNA提取产量有差异。

2、 真菌:Miseq DNA PE 文库浓度≥20 ng/ μl,总量≥6 μg(荧光定量);Miseq DNA MP 文库浓度≥40 ng/ μl,总量≥12 μg(荧光定量);454 DNA库浓度≥20 ng/ μl,总量≥3 μg(荧光定量)。提供组织样品应>1 g,尽量提供较多量,不同的物种DNA提取产量有差异。

3、样品保存期间切忌反复冻融。

4、送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封。

5、提供DNA电泳检测照片,用自封袋密封后随样品一起送样。

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