微生物基因组从头测序
概述:微生物广泛存在于自然界中,与人类的生产和生活息息相关。微生物生物多样性丰富,基因组具有相对较小、重复序列较高、易于突变等特点,因此很必要对微生物进行全基因组测序,而且同动植物相比较在时间和成本上也容易实现。目前,全基因组测序成为微生物遗传进化、疾病预防控制、生物工程技术等方面重要的研究和开发手段。
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常见问题
        微生物广泛存在于自然界中,与人类的生产和生活息息相关。微生物生物多样性丰富,基因组具有相对较小、重复序列较高、易于突变等特点,因此很必要对微生物进 行全基因组测序,而且同动植物相比较在时间和成本上也容易实现。目前,全基因组测序成为微生物遗传进化、疾病预防控制、生物工程技术等方面重要的研究和开 发手段。

样品要求
 
1、细菌:Miseq DNA PE文库浓度≥20 ng/ μl,总量≥6 μg(荧光定量);Miseq DNA MP文库浓度≥40 ng/ μl,总量≥12 μg(荧光定量);454 DNA库浓度≥20 ng/ μl,总量≥3 μg(荧光定量)。电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整,主带应在100 kb以上,DNA无降解,无污染提供菌粉>1 g,菌液>5 ml,尽量提供较多量,不同的物种DNA提取产量有差异。

2、 真菌:Miseq DNA PE 文库浓度≥20 ng/ μl,总量≥6 μg(荧光定量);Miseq DNA MP 文库浓度≥40 ng/ μl,总量≥12 μg(荧光定量);454 DNA库浓度≥20 ng/ μl,总量≥3 μg(荧光定量)。提供组织样品应>1 g,尽量提供较多量,不同的物种DNA提取产量有差异。

3、样品保存期间切忌反复冻融。

4、送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm 膜密封。

5、提供DNA电泳检测照片,用自封袋密封后随样品一起送样。